麦吉尔大学有23个学院，分称faculties和schools。

Macdonald校区是蒙特利尔岛上最大的绿地，是该地区最大的私人土地，也是McGill农业与环境科学学系 (AES) 的所在地。

AES 处于应用生物科学、食品、营养学和环境科学研究与教学的前沿。

该校区提供独特的跨学院研究项目，包括Bieler环境学院、人类营养学院、寄生虫学研究所和全球粮食安全研究所 。学生可选择的专业研究方向有动物科学、生物资源工程、食品科学与农业化学、自然资源科学、农业经济学和植物学等。学系内有著名的莱曼昆虫博物馆和麦吉尔大学植物标本馆。

文学教育为学生提供了探索人类历程和创造性的可贵机会，可将学生们培养成敬业的工作者、敏捷的思想家和拥有进取心的领导者。

麦吉尔的文学教育培养学生极佳的语言、批判和分析能力，学生们能快速高效地从多角度看待并处理问题或事件，有效应对新的全球发展，并适应不断变化的时事环境。

文学院除了关注国际、人口、公民、家庭、女权等各方面，更有跨学科项目可供选择。同时还建立了多个研究中心，如：东亚研究中心、Yan P. Lin 古代和现代世界自由与全球秩序研究中心 、土著保护和发展替代方案中心。

教育学院位于风景如画的皇家山脚下， 其历史可追溯至 1857 年。从那时起，教育工作者的角色发生了翻天覆地的变化。在面对不同时期的挑战时，学院都制定计划来帮助教育工作者们应对职业的变迁。

如今麦吉尔大学教育学院是世界上最好的教育学院之一。除了教育工作者，还有诸多麦吉尔大学校友从事着校长、院长、律师、心理学家、音乐家、运动员、职业运动队经理等职业。

麦吉尔大学工程学院主要关注水资源、材料、航空航天等各个工程领域的研究。其研究方向包括水资源管理、智能机器、工程与设计可持续性 、先进材料、航天材料等。该系横跨建筑、城市规划、生物工程、化学工程、土木工程、电气和计算机工程、机械工业、材料工程等多个专业。

 与其相关的研究所有Trottier工程与设计可持续性研究所 、麦吉尔先进材料研究所和麦吉尔航空航天工程研究所。

理学院旨在帮助解决经济和人类发展至关重要问题的领袖，其中包括环境科学、新材料和新技术等领域，并致力于在神经科学、天体物理学、环保化学和地球系统科学等不同领域，将学院内充满活力的年轻学者们培养成未来的科学家和各自领域的领导者。

法学院的教授团队中有许多国际法专家，他们积极参与了加拿大及海外的司法改革和法律机构事务 。法学院关注法律本身及其应用 ，下设三个研究中心：人权和法律多元化研究中心、知识产权政策研究中心、 魁北克私法和比较法研究中心 。

法学院还包含三个研究所：航空航天法研究所、比较法研究所和欧洲研究所。

法学院提供的跨学科项目包括 ：管理与法律联合项目、社会工作与法律联合项目、生物伦理学硕士专业、环境专业法学硕士。

麦吉尔大学的Desautels管理学院创立于1906年，被评为世界顶级国际商学院之一。

学院课程涉及本科、硕士、高级行政管理及博士级别 ，并拥有众多研究中心和学术项目。并且其课程为综合跨学科模式，课程中会结合教学、研究和实践提高学生的专业知识和管理能力。

麦吉尔医学院已连续18年被评为加拿大全国第一名的硕博类医学院。

医学院的宗旨是为加拿大人口当前和未来的健康需求做好充分准备。其学生在拥有卓越医术的同时，善于解决问题，能够作为多学科团队的一员发挥作用，并致力于终身学习，以高质量服务患者为目标，不断提升自己。

学生们与患者交流时，展现出极强的道德素养和同理心，善于有效地利用卫生健康资源，对健康和疾病机制的研究有着锲而不舍、积极探究的精神。

牙科医学和口腔健康科学学院希望营造一个人人关爱生命的世界，并在口腔健康的研究、创新和教育方面脱颖而出。

围绕着推进变革教育、科学方法介入、高质量研究和卓越临床培训为基础的终身学习使命，牙医学院的学习项目促进了综合护理、社区服务和社区参与度。

通过创造性的知识输入，分别连接基础、应用和转化型的牙科研究，通过强大的社区伙伴关系、国内及国际合作，麦吉尔的牙科医学和口腔健康科学学院为学生们提供了可持续学习 、提高学术连通和创新牙医技术的机会。

Schulich音乐学院在专业培训和研究方面体现了最高的国际水准，以管弦乐队、歌剧、爵士乐、早期音乐和当代音乐的课程而闻名世界。

Schulich音乐学院在录音和音乐技术方面也有着加拿大领先地位，其率先推动了音乐在社区间更广泛的合作与传播。